Положения, выносимые на защиту:

• «Вопросы Иоанна» являются источником, содержащим уникальные сведения о мировоззрении болгарских богомилов, которые невозможно извлечь из других имеющихся в нашем распоряжении источников.
• Полноценная работа с источником возможна лишь при использовании всех имеющихся публикаций его списков, а также переводов текста на основные языки историографии данной темы.
• Венская редакция текста является более близкой к славянскому оригиналу.
• В силу особенностей текста, в частности его элитарного характера, для адекватного понимания его содержания необходимо привлечение широкого культурного-исторического и литературного контекста.
• «Вопросы Иоанна» предлагают оригинальную картину мира, основанную на дуалистическом мировоззрении, основными чертами которого являются «разделённость» пространства, исторического времени, человека на антагонистичные дух и материю, а также мотив «пленения» человека в физическом мире, подобно душе в человеческом теле.
• В «Вопросах Иоанна» выдвигается проект социальной утопии, который последователи богомильской ереси пытались реализовать; он подразумевал социальную изоляцию, отказ от «человеческой» природы с присущими ей идентичностями в пользу конструирования нового «ангельского» индивида, принадлежавшего духовному миру, находящемуся за пределами видимого.
• Содержание текста «Вопросов» транслировалось элитарными группами богомильского сообщества его малограмотной части, а также потенциальным членам. Эта передача смыслов, отрицающих многие базовые идеи ортодоксального христианства, осуществлялась при активном использовании его дискурсивных и символических структур.